當紫水晶晶體中同時具有紫水晶以及黃水晶的區塊時又稱之為紫黃晶。

　據信天然的紫黃晶成因應該是含鐵的水晶受到地層中鉀衰變放出的游離輻射影響，使得部分鐵離子價位發生改變，而且會依循特定方向排列，因而使紫水晶內產生紫黃相間的區塊，以玻利維亞出產的紫黃晶最具代表性。(這段是翻譯國外文章，如有錯誤之處還請指正，謝謝！)

　除此之外，也有可能是因為紫水晶受到地層中的輻射或地熱，導致部分變色而形成局部黃色成為紫黃晶。